قصة الفيلم تدور حول مهندس معماري مشهور يدعى (موريا تيجي) يتحدى (سينشي كودو) في إيجاد قنابل بمؤقتات ذكية مزروعة في كامل أرجاء ناطحة السحاب الجديدة التي بناها. و الدافع الرئيسي وراء ذلك كان امساك سينشي على خلفية جريمة لعمدة منطقة نشيتاماش التي كانت ستبنى فيها مدينة جديدة يشرف عليها (موريا تيجي) مما حطم حلمه. يتمكن كونان في النهاية من هزيمة موريا تيجي بصوت سينشي لا بصوت موري كوغورو ليقبض عليه. عندما تتبقى في النهاية قنبلة في صالة بيكا للسينما المتواجدة في ناطحة السحاب تقوم ران في آخر الثواني بإبطال مفعول القنبلة بقطع السلك الأزرق.